江戸川 コナン(에도가와 코난) 겉보기에는 어린아이같지만 정체는 일본 경찰의 구세주라고 불리는 고등학생 명탐정・工藤 新一(쿠도우 신이치). 소꼽친구이자 동급생의 蘭(란)과 유원지에서 데이트를 하던 도중에 검은 조직이 먹인 독약으로 소학생의 모습으로 변하고 말았다. 그후, 정체를 숨기기 위해서 江戸川 コナン(에도가와 코난)라는 가명으로 소꼽친구인 毛利 蘭(모리 란)의 집에서 식객으로 지내면서 수많은 사건을 해결하고 있다. 모든 것은 원래의 자신응로 돌아가기 위한 일이다.
毛利 蘭(모리 란) 新一(신이치)의 소꼽친구로 帝丹高校(테이탄 고등학교)의 2학년B반으로 공수부 주장을 맡고 있으며 도대회에서 NO.1의 실력을 가진 문무양도의 여고생. 新一(신이치)를 계속 좋아해왔고 갑자기 사라진 그를 기다리고 있다. 때로는 コナン(코난)의 명추리에 新一(신이치)의 모습이 겹쳐보일 때도 있지만 コナン(코난)을 시작해서 少年探偵団(소년탐정단)을 어머니와 같은 상냥함으로 돌봐준다. 또, 소꼽친구의 鈴木 園子(스즈키 소노코)와 친하고 옛날부터 이야기가 잘 맞는다.
服部 平次(핫토리 헤이지) 관서에서 유명한 고등학생 탐정. 추리력은 같은 나이의 新一(신이치)에게 뒤지지 않는다. 아버지의 服部 平蔵(핫토리 헤이조)는 오오사카부경 본부장. 덕분에 어릴 때부터 알고 지낸 大滝警部(오타키 경부)등이 몰래 수사정보를 알려줄 때도 있다. 또, 추리력과 함께 아버지에게 이어받은 검도 실력은 상당하다. 참고로 검은띠로 선조 대대로 이어지고 있다고 한다. コナン(코난)의 정체가 新一(신이치)라고 알고 있는 인물 중 한 명으로 コナン(코난)과 같이 콤비로 어려운 사건들을 많이 해결하고 있다. 소꼽친구의 和葉(카즈하)가 말하기를 平次(헤이지)와 コナン(코난)이 같이 있는 모습은 형제로 보이며 コナン(코난)의 위기상황을 맞으면 일부러 오사카에서 도쿄까지 오기도 한다.
遠山 和葉(토오야마 카즈하) 平次(헤이지)의 소꼽친구이자 여자친구. 아버지는 오오사카부경 경찰부장. 솔직하고 마음이 따뜻하며 세심하다. 합기도2단의 실력자로 平次(헤이지)의 누나 역할이라고 말하지만 사실은 平次(헤이지)에게 홀딱 반해있다? 한 때는 蘭(란)과 平次(헤이지)의 사이를 오해하고 질투했지만 지금은 蘭(란)과 아주 사이가 좋다!
怪盗キッド(괴도키드) 변장의 달인으로 세계를 소란스럽게 만드는 신출귀몰의 도둑. 그 국제범죄자의 번호에서 키드1412호라고 불리고 있으며 반드시 예고장을 보내지만 경찰을 완벽하게 농락하고 있다. 도둑질을 성공하는 훌륭한 솜씨로 사람들은“怪盗キッド(괴도키드)”라고 부르고 있다. 사실은 현재 怪盗キッド(괴도키드)는 2대째로 정체는 고등학생 黒羽 快斗(쿠로바 카이토). 그는 돌아가신 아버지의 사인을 찾기 위해서 그 뒤를 이어서 怪盗キッド(괴도키드)가 되었고 빅주얼리라고 불리는 보물을 찾고 있다.
灰原 哀(하이바라 아이) 겉보기에는 어린아이같지만 사실은 검은 조직으로 新一(신이치)가 먹은 독약을 개발하던 연구자로 코드네임은 シェリー(셰리). 언니가 살해당하고 조직을 배신했지만 탈출하기 위해서 독약을 먹고 소학생의 모습이 되었다. 현재는 阿笠 博士(아가사 히로시)에게 신세지고 있으며 コナン(코난)과 같이 帝丹小学校(테이탄 소학교)1학년B반에 다니면서 해독제를 연구하고 있다. 이 세상에 단 한 명, コナン(코난)과 같은 처지로 서로 잘 맞는다.
阿笠 博士(아가사 히로시) 新一(신이치)의 옆 집에 사는 별난 발명가로 コナン(코난)의 정체를 알고 있는 인물 중 한 명. 나비 넥타이형 음성 변조기와 증강력 운동화, 탐정 배지에서 축구공 발사 벨트 등 많은 탐정 용품을 발명해준 좋은 이해자. 少年探偵団(소년탐정단)도 돌봐주고 있으며 灰原 哀(하이바라 아이)가 조직을 탈출한 후로 그녀를 보호하고 있다.